UCell:单细胞评分分析R包及可视化应用

****单细胞评分我们之前说过AUCell和seurat自带的打分函数： 跟着Cell学单细胞转录组分析(十一):单细胞基因评分|AUCell评分 我们之前讲过单细胞评分，一个是Seurat自带的打分函AddModuleScore()。一个是AUcell包。最近看到一个评分R包，感觉还是挺好的这里分享一下。Ucell是基于Mann-Whitney U统计的单细胞评分R包，灵感来源于SUCell，使用起来稳定性较好，且与其他的方式相比较，Ucell计算所需的时间和耗费的内存更小。即使在计算能力有限的机器上也可以在几分钟内处理大型数据集。UCell可以应用于任何单细胞数据矩阵，可直接与Seurat对象交互。Ucell在高分SCI文章的应用还是挺多的，我们在自己的分析中也可以视情况选择使用。原始文献参考： https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021002816?via%3Dihub这里我们使用seurat单细胞对象进行演示。首先对单细胞marker基因的评分，这个有利于细胞分群的鉴定。